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重组腺相关病毒(rAAV)纯化技术与工艺进展:基因治疗产业化的关键一步

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重组腺相关病毒(rAAV)纯化技术与工艺进展:基因治疗产业化的关键一步

近年来,腺相关病毒(AAV)因其致病性低、基因表达持久等优势,已成为基因治疗领域最重要的递送载体之一。当前,已有多款基于重组腺相关病毒(rAAV)的基因治疗产品在欧美获批,用于治疗遗传性失明、血友病和肌营养不良等疾病。

 

然而,与临床需求的快速增长相比,rAAV 的规模化生产与纯化工艺仍是制约产业发展的核心瓶颈之一。

 

本文将聚焦 rAAV 的纯化技术路线,系统梳理不同生产体系对下游工艺的影响,以及近年来在捕获、精纯和放大方面的关键进展。

 

rAAV 的生产方式决定了纯化难度

 

AAV 本身是一种无囊膜、单链 DNA 病毒,无法自主复制,必须依赖辅助病毒(如腺病毒或疱疹病毒)。rAAV 在此基础上进一步去除了 Rep Cap 基因,仅保留衣壳并携带治疗性转基因,从而具备更高的安全性,但也无法在生产体系中自我扩增。

 

目前主流的 rAAV 生产体系主要包括:

 

1. HEK293 细胞瞬时转染体系:这是最常见的实验室与早期工艺路线,通过多质粒转染表达 Rep/Cap、辅助基因及转基因。该方法灵活性高,但产量低、空壳比例高(常超过 80%),对下游纯化提出了极高要求。

2. 昆虫细胞-杆状病毒体系:该体系具备良好的放大潜力,曾用于首个获批 rAAV 药物 Glybera® 的生产。但其缺点是缺陷颗粒和非感染性病毒比例较高,纯化难度依然显著。

3. 重组疱疹病毒(rHSV)体系:利用 HSV 天然的辅助病毒功能,可实现高滴度、高质量 rAAV 生产。但该体系对起始物料制备要求高,且必须在下游中彻底去除具有神经毒性的 HSV 残留。

4. 稳定生产细胞系:通过构建稳定表达 Rep/Cap 的细胞系,再用腺病毒诱导表达。该方法重复性和放大性较好,但仍需严格去除残留腺病毒和宿主 DNA

 

总体而言,上游生产方式的选择直接决定了下游纯化的复杂度和成本结构。

 

rAAV 下游纯化的核心挑战

 

无论采用何种生产体系,rAAV 纯化均需面对以下共性难题:

  • 病毒滴度低

  • 完整衣壳与空壳结构高度相似

  • 辅助病毒、宿主 DNA 和蛋白残留复杂

  • 纯化过程损耗大、放大难度高

  • 尚未形成类似单抗那样的标准化平台工艺

 

因此,下游工艺往往成为限制 rAAV 成本与可及性的决定性因素。

 

rAAV 纯化的关键工艺步骤

 

1. 细胞收获与裂解:小规模研究中常采用冻融法,但在工业规模下,更常使用裂解试剂处理或高压均质破碎技术,可在裂解细胞的同时剪切 DNA、降低黏度,利于后续澄清。

2. 澄清与初步浓缩:裂解液需去除细胞碎片和大颗粒杂质。当前主流方案包括:

  • 深层过滤:温和、可放大

  • 切向流过滤(TFF):可实现约 10 倍浓缩,同时去除可溶性杂质,已成为 rAAV 工艺中的标配步骤

3. 病毒捕获:早期使用碘克沙醇或 CsCl 密度梯度超速离心,但该方法劳动强度大、通量低、不适合放大,且 CsCl 会损伤衣壳。目前主流方案为亲和层析,利用 AAV 衣壳特异性配体进行捕获。层析方法具有高选择性和高回收率,但成本高、载量有限,且多为血清型特异性。

 

近年来的新进展包括:

  • 跨血清型配基(如 AAVX,可覆盖 1–9 型)

  • 基于 AAV 受体的生物学配体

  • 计算设计的多肽配体,具备成本低、洗脱条件温和的潜力

  • 水相双相体系(ATPS),利用物理化学差异实现温和分离

  • 空间排阻层析(SXC),结合 PEG 分子拥挤效应和亲水膜,载量可显著高于传统亲和填料

 

4. 精纯纯化:去除空壳的关键:捕获步骤无法区分完整衣壳与空壳,因此精纯步骤是 rAAV 工艺的核心难点。

 

当前最常用的方法是:

  • 离子交换色谱(IEX)(阴/阳离子交换,常串联使用)

  • 通过微小的表面电荷差异区分满壳、空壳和部分装载颗粒

此外,新兴技术还包括:

  • 整体柱(Monolith column):连续多孔结构,大幅提高流速

  • 膜层析:高通量、低剪切、感染性保持良好

 

虽然超速离心仍可用于实验室或小规模生产,但其产率低、不可放大,在商业化生产中逐步被柱层析替代。

 

行业展望:从可行走向可规模化

 

与早期临床阶段相比,rAAV 纯化技术已取得显著进步。完整衣壳回收率已从早期不足 10% 提升至约 60%,这主要得益于层析材料与工艺设计的持续优化。

 

当前的发展趋势包括:

  • 捕获与精纯层析的进一步放大

  • 膜技术与连续工艺的应用

  • 更高分辨率的分析手段

  • 借鉴单抗与重组蛋白领域的成熟经验

 

尽管 rAAV 在结构与工艺上具有自身独特挑战,但在临床需求和资本推动下,纯化技术正成为推动基因治疗产业化的关键创新高地。可以预见,随着材料、设备和工艺集成能力的不断提升,rAAV 的规模化、可负担生产将逐步成为现实。